首先，眼睛的颜色和显性基因有关，而和隐形基因的关系就不大了（这里说的只是颜色的深度，而不包括眼睛的形状之类的其他基因）。 举个特别简单的例子，一只棕色泰迪和一只黑色泰迪繁殖，结果生出来的小狗眼睛有的可能是黑的、有的是棕色的，这和两个公犬（假设都是黑色的泰迪）的基因型有关系，但和母犬的眼睛颜色没有关系。 再举个例子，一个纯白的贵宾和一个黑色的贵宾繁殖，理论上说后代有可能出现各种颜色的眼睛，也就是和显性基因无关了。（不过这个例子不太恰当，应该是一个颜色浅的贵宾和一个颜色深的贵宾繁殖，才能得出眼睛颜色的差异） 所以题主担心的问题其实不需要担忧，狗狗的眼睛颜色会和它父母的眼睛颜色有所差异，但这种差异是随机出现的，不存在“好看”或者“不好看的规律”。
另外，人的眼睛也是有变色功能的，比如阳光刺激的时候会变深，而在黑暗中则会更亮一些…… 也就是说，在黑暗处看一个人，如果此人瞳孔颜色较暗，那么此人的眼睛显然是不太正常的。。。
江晨优质答主在人类的审美中，我们往往认为黑色的眼睛是最好看的，但对狗狗来说就不一定了。其实几乎所有的狗狗出生的时候眼睛都是蓝色的，这是由于犬眼虹膜部分发育不全造成的，所以还无法呈现该品种应有的固有颜色。犬眼的颜色多半会随着犬龄的增长而产生变化，一般在犬宝宝约8周大的时候会有一次颜色的转变（由蓝色转为棕色），在犬宝宝2-3月龄时会再一次发生颜色变化。
一般说来，小型犬通常在3个月龄左右能够完全上色，而大型犬则可能要到8-9个月时眼睛才能完全上色。犬眼最终的颜色和品种有关系，一般黑色被毛、色系较深的犬只眼色往往也较深，比如红色贵宾犬的眼睛颜色可能会略浅些。
在一些相对少见的犬种中，犬眼的蓝色可能是基因造成的，比如我们经常见到的边境牧羊犬，一般该品种眼睛颜色深者通常为黑色，而浅色则可能会是棕色或者蓝色。另外，一些白色被毛犬（主要是指粉鼻白色犬种，比如贵宾犬、比熊犬等），犬眼可能会呈现红褐色，这主要是由于该类犬的虹膜缺乏黑色的色素，所以通常瞳孔的颜色相对也偏浅，并且一般此类犬种也可能呈现异色眼或蓝色眼。
如果你的狗狗的眼睛上色了，但眼睛为浅蓝色眼或蓝白色眼，最好选择犬的眼睛颜色相同；如果一只是深色眼，另一只是浅色眼或白色眼，最好选择犬眼颜色较深的一只。在实际生活中确实也发现有少数犬的深色眼后期可能会转为浅色眼，这样的犬如果做繁殖犬，可能会影响到后代眼部的健康。
